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技术服务类别
DNA PullDown
DNA PullDown实验是反向筛选 DNA 结合蛋白的核心技术,从已知 DNA 调控元件出发,寻找结合的转录因子、调控蛋白,解决 “已知 DNA 元件,找结合蛋白” 的研究痛点。
将待测 DNA 序列(启动子、顺式作用元件)进行生物素标记,制备双链探针;与细胞核蛋白孵育后,利用链霉亲和素磁珠特异性富集与 DNA 探针结合的蛋白,经洗涤洗脱后,通过 WB 鉴定已知蛋白、质谱筛选未知结合蛋白。
将待测 DNA 序列(启动子、顺式作用元件)进行生物素标记,制备双链探针;与细胞核蛋白孵育后,利用链霉亲和素磁珠特异性富集与 DNA 探针结合的蛋白,经洗涤洗脱后,通过 WB 鉴定已知蛋白、质谱筛选未知结合蛋白。
详情介绍
实验简图
实验流程
1.合成生物素标记的双链 DNA 探针,退火制备;
2.提取高质量细胞核蛋白;
3.探针与核蛋白体外结合,设置突变探针阴性对照;
4.链霉亲和素磁珠富集结合蛋白,严格洗涤去除杂质;
5.洗脱蛋白,WB 验证已知蛋白,质谱筛选未知蛋白。
实验周期
DNA PullDown+wb检测:10-14 个工作日
DNA PullDown+ms检测:25-30 个工作日
需提供样品信息
1.待测 DNA 序列、结合位点信息;
2.细胞 / 组织样本、核蛋白样本。
应用场景
1.启动子 / 增强子结合转录因子筛选与验证;
2.顺式作用元件结合蛋白鉴定;
3.已知 DNA 元件的调控蛋白挖掘。
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