武汉本脉生物科技有限公司
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RNA - 蛋白互作类实验
技术服务
RNA PullDown
RNA PullDown
RNA PullDown是反向筛选 RNA 结合蛋白的核心技术,从已知 RNA 出发,寻找结合的 RBP、功能蛋白,解决 “已知 RNA,找结合蛋白” 的研究痛点,常与 RIP 互补使用。
体外转录制备生物素标记的目标 RNA 探针,与细胞总蛋白 / 核蛋白孵育,利用链霉亲和素磁珠特异性富集与 RNA 探针直接结合的蛋白,洗涤洗脱后,通过 WB 验证已知蛋白、质谱筛选未知结合蛋白,是体外 RNA - 蛋白直接互作的核心技术。

详情介绍

实验简图


实验流程
1.体外转录制备生物素标记的目标 RNA 探针,纯化质控;
2.提取细胞总蛋白 / 核蛋白,全程 RNase-free 操作;
3.RNA 探针与蛋白体外结合,设置突变 RNA 阴性对照;
4.链霉亲和素磁珠富集结合蛋白,严格洗涤去除杂质;
5.洗脱蛋白,WB 验证已知蛋白,质谱筛选未知 RBP。

实验周期
RNA PullDown+wb检测:12-18 个工作日
RNA PullDown+ms检测:25-30 个工作日

需提供样品信息
1.目标 RNA 全长 / 序列信息;
2.细胞 / 组织蛋白样本。

应用场景
1.lncRNA/circRNA/mRNA 的结合 RBP 筛选与验证;
2.体外 RNA - 蛋白直接互作验证;
3.非编码 RNA 调控机制深度解析。

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