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RIP-qPCR RNA 结合蛋白免疫沉淀定量 PCR
RIP-qPCR是体内 RNA - 蛋白互作金标准技术,真实反映生理状态下 RBP 与 mRNA、lncRNA、circRNA 的结合关系,是非编码 RNA 机制研究的核心必备实验。
温和裂解细胞,保留体内天然形成的RNA - 蛋白复合物,通过特异性 RNA 结合蛋白(RBP)抗体,富集蛋白及其结合的 RNA,去除游离蛋白与 DNA 后,纯化结合的 RNA,通过 qPCR 定量靶标 RNA 富集效率,验证体内 RNA - 蛋白互作。
温和裂解细胞,保留体内天然形成的RNA - 蛋白复合物,通过特异性 RNA 结合蛋白(RBP)抗体,富集蛋白及其结合的 RNA,去除游离蛋白与 DNA 后,纯化结合的 RNA,通过 qPCR 定量靶标 RNA 富集效率,验证体内 RNA - 蛋白互作。
详情介绍
实验简图
实验流程
1.活细胞收集,冰上温和裂解,保留 RNA - 蛋白复合物;
2.特异性抗体与磁珠预结合,富集 RBP 及其结合 RNA;
3.严格洗涤去除非特异性结合,DNase 酶消化去除基因组 DNA;
4.纯化 RNA,反转录 cDNA,qPCR 定量靶标 RNA 富集倍数。
实验周期
常规单样本检测:12-16 个工作日
需提供样品信息
1.新鲜培养细胞、冻存组织样本;
2.RBP 特异性 IP 级抗体;
3.靶标 RNA 序列、引物信息。
应用场景
1.体内 RBP 与 lncRNA/circRNA/mRNA 互作验证;
2.非编码 RNA 调控机制、RNA 稳定性、翻译调控研究;
3.miRNA 装载复合物验证。
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仪器设备
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